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一种挖掘鸡胚胎干细胞向雄性生殖细胞分化过程中关键lncRNA 的分析方法
- 专利权人:
- 扬州大学
- 发明人:
- 李碧春,李东,张亚妮,纪艳芹,王飞,汪怡临,王颖洁,路镇宇,靳锴,何娜娜
- 申请号：
- CN201610252399.1
- 公开号：
- CN105838791A
- 申请日:
- 2016.04.21
- 申请国别(地区):
- 中国
- 年份:
- 2016
- 代理人:
- 许必元
- 摘要：
- 本发明公开了一种挖掘鸡胚胎干细胞向雄性生殖细胞分化过程中关键lncRNA的分析方法，本方法首先从如皋黄鸡的新鲜受精蛋的胚盘、第19期(72h)的生殖脊和第18天的睾丸，分离出鸡ESCs、PGCs和SSCs,并根据CDH1基因设计特异性，以PCR扩增的方法进行性别鉴定，对运用抗体标记的ESCs、PGCs和SSCs进行分选,阳性细胞提取细胞总RNA，纯化后对RNA质量进行检测，检测合格后进行RNA‑Seq测序。将测序结果中筛选出组装RNA的转录本。分离鸡ESCs，PGCs和SSCs，提取总RNA，反转录为cDNA。对候选的lncRNA进行Trans和Cis靶基因的预测分析，并通过DAVID数据库查找其GO功能项，再通过GO分析注释其功能，对其进行功能分析。绘制关键lncRNA及其靶基因与相关信号通路之间的关系互作网络图。
- 来源网站：
- 中国工程科技知识中心
- 来源网址：
- http://www.ckcest.cn/home/
