A heart rate measuring system for a fetus according to an embodiment of the present invention includes: an adaptive filter which removes only the electrocardiogram signal of a mother from the electrocardiogram signal of the mother and the electrocardiogram signal of the fetus; an online empirical mode decomposition (EMD) which decomposes a signal extracted from the adaptive filter into multiple intrinsic mode function (IMF) signals; a window designating unit which designates a window based on the peak value of a phonocardiogram signal of the fetus; and a synthesizing unit which synthesizes the window designated by the window designating unit with the electrocardiogram signal selected among the IMF signals decomposed by the online EMD. A signal included in the window is drawn as a final electrocardiogram signal of a fetus among signals synthesized by the synthesis unit. According to an embodiment, the present invention is able to handle a situation fast according to the state of a fetus by consistently monitoring the state of the fetus since the electrocardiogram of the fetus can be measured in real time.본 발명의 실시예에 따른 태아의 심박동수 측정시스템은, 산모와 태아의 심전도 신호에서 산모의 심전도 신호만을 제거하는 적응형 필터; 상기 적응형 필터에서 추출된 신호를 다수개의 IMF(Intrinsic mode functions) 신호로 분해하는 Online EMD(Empirical mode decomposition); 태아의 심음도 신호의 피크값을 기준으로 윈도우를 지정하는 윈도우 지정부; 및 상기 Online EMD에 의해 분해된 IMF 신호 중에서 선택된 심전도 신호에 상기 윈도우 지정부에 의해 지정된 윈도우를 합성하는 합성부;를 포함하며, 상기 합성부에 의해 합성된 신호 중에서, 상기 윈도우에 포함되는 신호가 태아의 최종적인 심전도 신호로 도출되는 것을 특징으로 한다. 실시예의 따르면 실시간으로 태아의 심전도를 측정할 수 있기 때문에 태아의 상태를 지속적으로 감시할 수 있어, 태아의 상태에 따라 빠른 대처가 가능한 장점이 있다.