The present invention relates to a method and system for treating fish for calcium sensitive ectoparasites by containing the fish for a period in softened seawater having a salinity in the range from 0.5 to 15 g/kg, determined as the total mass of Na+, K+, Ca2+, Mg2+, Cl-, HCO3 -, CO3 2-, and SO4 2- ions being present in a sample of one kg of the softened seawater, and a Ca2+ content of ≤ 100 mg/kg, determined as the mass of Ca2+ ions in a sample of one kg of the softened seawater.La présente invention concerne un procédé et un système pour traiter des poissons contre des ectoparasites sensibles au calcium en maintenant les poissons pendant une durée donnée dans de l'eau de mer adoucie ayant une salinité dans la plage de 0,5 à 15 g/kg, déterminée comme masse totale d'ions Na+, K+, Ca2+, Mg2+, Cl-, HCO3-, CO32- et SO42- présents dans un échantillon d'un kg d'eau de mer adoucie, et une teneur en Ca2+ ≤ 100 mg/kg, déterminée comme masse d'ions Ca2+ dans un échantillon d'un kg d'eau de mer adoucie.