生物基因组简单重复序列的发掘方法及设备
- 专利权人:
- 中国农业科学院烟草研究所
- 发明人:
- 任民,王志德,刘艳华,张兴伟,牟建民
- 申请号:
- CN201110414015.9
- 公开号:
- CN102495977A
- 申请日:
- 2011.12.13
- 申请国别(地区):
- 中国
- 年份:
- 2012
- 代理人:
- 赵建刚
- 摘要:
- 本发明公开了一种生物基因组简单重复序列的发掘方法,其特征在于,包括以下步骤:根据需要发掘的生物基因组简单重复序列SSR的特征构建正则表达式;通过所述正则表达式分析待分析序列,判断所述待分析序列中是否存在符合所述正则表达式要求的目标SSR,如果判断结果为是,则输出所述目标SSR;如果判断结果为否,则显示所述待分析序列中不存在所述目标SSR的信息。因此,本发明提供的生物基因组简单重复序列的发掘方法及设备,在对SSR发掘过程中,不会产生冗余结果,从而降低了SSR发掘过程的配置复杂度,提高了SSR发掘的效率,降低了SSR发掘软件的开发难度。
- 来源网站:
- 中国工程科技知识中心