The present invention is directed to PNA oligomers that comprise an N-terminal bis- protected-diamine amino acid (e.g., a bis-Fmoc-protected lysine) moiety. The presence of the bis-protected diamine moiety can be used as a purification handle that permits separation between fully elongated PNA oligomer from truncated/capped failure sequences. After purification/separation, the protecting groups can then be removed from the PNA oligomer, and the resulting deprotected PNA oligomer optionally again purified. The methods disclosed herein are particularly useful for purifying longer PNA oligomers (e.g., oligomers of greater than 18 residues in length), including tail-clamp PNA oligomers, and/or PNA oligomers comprising two or more unnatural nucleobases.La présente invention concerne des oligomères APN qui comprennent un acide aminé bis-protégé par diamine en position N-terminale (par exemple, une fraction lysine protégée par bis-Fmoc). La présence de la fraction bis-protégée par diamine peut être utilisée en tant que poignée de purification qui permet une séparation entre un oligomère APN entièrement allongé à partir de séquences de défaillance tmnisées/coiffées. Après purification/séparation, les groupes protecteurs peuvent ensuite être éliminés de l'oligomère APN, et l'oligomère APN déprotégé résultant est éventuellement à nouveau purifié. Les procédés de l'invention sont particulièrement utiles pour purifier des oligomères APN plus longs (par exemple, des oligomères de plus de 18 résidus de longueur), comprenant des oligomères APN à pince de queue, et/ou des oligomères APN comprenant deux nucléobases non naturelles ou plus.