本发明公开一种香港巨牡蛎BPI基因、编码蛋白及其克隆方法和重组香港巨牡蛎BPI基因工程菌构建方法及其重组蛋白的应用。本发明香港巨牡蛎BPI基因序列如ESQ ID NO:1所示,其克隆方法为根据与BPI基因同源的保守序列设计特异引物扩增基因;香港巨牡蛎BPI蛋白序列如SEQIDNO.2所示;用分别含有NdeI位点和XbaI位点的引物扩增香港巨牡蛎BPI成熟蛋白;将克隆得到的目的基因插入载体获得重组质粒,对重组质粒进行诱导表达,再进行纯化复性即获得基因工程菌,优点是对溶藻弧菌和副溶血弧菌具有明显的杀菌作用。