本发明公开了一种草鱼呼肠孤病毒Ⅱ型S10基因编码的重组蛋白、由其制备的多克隆抗体及应用。草鱼呼肠孤病毒Ⅱ型S10基因编码蛋白,其氨基酸序列如SEQ ID NO:2所示,编码该蛋白的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示。本发明获得的重组蛋白具有较好的免疫原性,与GCRV其它结构蛋白相比,其诱导免疫动物产生的特异性抗体效价更高。进一步试验表明,用S10重组蛋白免疫草鱼,可使草鱼诱导产生较高的特异性抗体,并能对草鱼呼肠孤病毒强毒株的攻击起到一定的免疫保护作用。因此,对GCRV Ⅱ型S10基因编码蛋白的研究和应用,对开发草鱼出血病新型疫苗及免疫学检测试剂盒具有极其重要的意义,为草鱼出血病提供新的有效解决途径。