The present invention provides a fusion protein comprising an FGF21 variant protein and an Fc region of an immunoglobulin. The fusion protein of the present invention exhibits improved pharmacological efficacy, in vivo duration and protein stability, and pharmaceutical compositions comprising the fusion protein as an active ingredient are diabetic, obese, dyslipidemia, metabolic syndrome, It can be effectively used as a therapeutic agent for nonalcoholic fatty liver disease or nonalcoholic steatohepatitis.本願発明は、FGF21変異体タンパク質および免疫グロブリンのFc領域を含む融合タンパク質を提供する。本願発明の融合タンパク質は、改善された薬理学的有効性、インビボ持続時間およびタンパク質安定性を示し、活性成分として融合タンパク質を含む医薬組成物は、糖尿病、肥満、脂質異常症、メタボリック・シンドローム、非アルコール性脂肪肝疾患または非アルコール性脂肪性肝炎に対する治療剤として有効的に使用され得る。