本发明属于大豆分子生物学技术领域,具体涉及一种与大豆种子油分含量相关的分子标记、区间、引物及应用。所述SNP标记位于大豆第10号染色体的9763969位,所述分子标记的核苷酸为C或T;含有所述标记序列的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示;所述标记区间是大豆第10号染色体的9753969位‑9773969位区间。该SNP标记属于共显性的标记,可靠且使用方便,这为大豆高油分品系选育提供了极大的便利,可应用于大豆种子油分组分改良中的分子标记辅助选择以及在种子油分含量相关基因的精细定位以及图位克隆中的应用,从而加速大豆种子油分含量性状的改良进程。