Disclosed are a complex formulation for oral administration comprising probiotic formulation and 5-HT4 receptor agonist, and a method for the preparation thereof.본 발명은 유산균 제제 및 5-HT4 수용체 효능제를 함유하는 경구 투여용 복합 제제 및 이의 제조방법에 관한 것으로, 본 발명의 복합 제제는 위장관내 약물의 방출 부위를 다르게 하여 유산균 제제 및 5-HT4 수용체 효능제 각각의 효능을 극대화시키고, 복합 제제를 통한 처방의 단순화로 환자의 복약 순응도를 향상시킬 수 있다.