PROBLEM TO BE SOLVED: To provide an endoscope system capable of posteriorly validating whether or not pre-photography is performed under an appropriate condition, a processor device, and an operation method of the endoscope system.SOLUTION: An endoscope system 10 comprises: an image acquisition section 44 that includes an oxygen saturation calculation part 73 for calculating an oxygen saturation of an observation object using an LUT (a Look-up Table) 75 and, prior to the calculation of the oxygen saturation, acquires a correction image 86 acquired by capturing the observation object； an image correction amount calculation section 126 that calculates an image correction amount of an oxygen saturation calculation image 76 using the correction image 86； an image correction section 128 that corrects the oxygen saturation calculation image 76 in accordance with the image correction amount； and a storage section 92 that stores the correction image 86, and an oxygen saturation image 130 representing the oxygen saturation calculated by the oxygen saturation calculation part 73 using the corrected oxygen saturation calculation image, in association with each other.SELECTED DRAWING: Figure 16【課題】プレ撮影が適切な条件下で行われたかどうかを事後的に検証することができる内視鏡システム、プロセッサ装置、及び内視鏡システムの作動方法を提供する。【解決手段】内視鏡システム１０は、ＬＵＴ７５を用いて観察対象の酸素飽和度を算出する酸素飽和度算出部７３を有し、酸素飽和度の算出に先立って観察対象を撮像して得る補正用画像８６を取得する画像取得部４４と、補正用画像８６を用いて酸素飽和度算出用画像７６に対する画像補正量を算出する画像補正量算出部１２６と、画像補正量にしたがって酸素飽和度算出用画像７６の補正をする画像補正部１２８と、補正用画像８６と、補正後の酸素飽和度算出用画像を用いて酸素飽和度算出部７３で算出した酸素飽和度を表す酸素飽和度画像１３０とを関連付けて保存する保存部９２と、を備える。【選択図】図１６
