Provided herein are methods, systems, and kits for improving the current clinical pathway of care for lung conditions using genomic classifiers at various decision points within the existing pathway to minimize unnecessary invasive procedures, enhance early detection and disease recurrence, and monitor efficacy of interventive therapies for prevention or disease reversal.L'invention concerne des méthodes, des systèmes et des kits destinés à améliorer le chemin clinique actuel de soins pour les affections pulmonaires, au moyen de classificateurs génomiques à divers points de décision sur le chemin existant, afin de réduire au minimum les actes invasifs inutiles, améliorer la détection précoce, notamment de la récidive de maladies, et surveiller l'efficacité de traitements d'intervention dans la prévention ou la régression de maladies.