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基于二代测序的肿瘤新生抗原检测方法、装置和存储介质
专利权人:
深圳裕策生物科技有限公司
发明人:
王佳茜,高志博,陈龙昀,李淼
申请号:
CN201810601500.9
公开号:
CN108796055A
申请日:
2018.06.12
申请国别(地区):
中国
年份:
2018
代理人:
李小焦`彭家恩
摘要:
本申请公开了一种基于二代测序的肿瘤新生抗原检测方法、装置和存储介质。本申请的肿瘤新生抗原检测方法包括,变异检测步骤、MHC分子鉴定步骤、变异注释步骤、突变肽段预测步骤、突变肽段MHC/II型亲和力预测步骤、抗原表达丰度检测步骤、克隆性分析步骤和候选肿瘤新生抗原综合打分排序步骤;其中,新生抗原综合打分排序步骤包括按照公式一,根据MHC亲和力、抗原表达丰度和克隆性对新生抗原进行打分排序。本申请的肿瘤新生抗原检测方法,直接以二代测序的比对文件为基础进行突变和MHC检测,并且从MHC I/II型亲和力、抗原表达丰度、克隆性三个维度对候选肿瘤新生抗原进行打分,从而筛选出高质量的肿瘤新生抗原,为基于肿瘤新生抗原的免疫治疗奠定了基础。
来源网站:
中国工程科技知识中心
来源网址:
http://www.ckcest.cn/home/

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