Methods and compositions relating to the engineering of an improved protein with homocyst(e)inase enzyme activity are described. For example, there are disclosed modified cystathionine-γ-lyase (CGL) enzymes comprising one or more amino acid substitutions and capable of degrading homocyst(e)ine. Furthermore, provided are compositions and methods for the treatment of homocystinuria or hyperhomocysteinemia with homocyst(e)ine depletion using the disclosed enzymes or nucleic acids.L'invention concerne des procédés et des compositions se rapportant à l'ingénierie génétique d'une protéine améliorée ayant une activité enzymatique homocyst(é)inase. Par exemple, l'invention concerne des enzymes cystathionine-Y-lyase (CGL) modifiées comprenant une ou plusieurs substitutions d'acides aminés et capables de dégrader l'homocystéine. En outre, l'invention concerne des compositions et des procédés pour le traitement de l'homocystinurie ou de l'hyperhomocystéinémie avec une déplétion d'homocystéine à l'aide des enzymes ou des acides nucléiques de l'invention.