Systems and methods are provided for collecting and processing physical spatial data used during performing image guided surgical (IGS) procedures. The method includes rigidly aligning a computer model of a non-rigid structure in a subject patient with surface data in patient space associated with at least a portion of the non-rigid structure; and organ shape of the computer model and data Computing a deformation of the computer model that provides a non-rigid registration with a representation, the deformation being a set of defined for the computer model based on the rigid registration and a parameterized function. And computing using boundary conditions and field variables.画像誘導外科的(IGS)処置を実施する間に使用される物理的空間データを収集および処理するシステムおよび方法を提供する。本方法は、対象とする患者における非剛体構造のコンピュータモデルを、前記非剛体構造の少なくとも一部に関連付けられた患者空間における表面データと剛体位置合わせすることと、前記コンピュータモデルとデータの器官形状表示との非剛体位置合わせを提供する前記コンピュータモデルの変形を演算することであって、前記変形は、前記剛体位置合わせとパラメータ化関数とに基づいて前記コンピュータモデル用に定義された1セットの境界条件およびフィールド変数を用いて演算されることとを含む。