本发明提供一种检测猫杯状病毒的方法,其中使用的引物对的上下游引物的序列分别为SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:2。本发明筛选的引物既能保证鉴定病原的正确,又不能漏检同种不同株病原。另外,本发明的扩增片段长度适宜,既能在电泳中相互分开,又不太离散,避免多重PCR中优先扩增小片段后阻碍长片段扩增的情形,同时引物二聚体等非特异性扩增产物很少。另外,通过荧光定量反应体系和反应条件的优化,得到特异性和灵敏性较高的FCV的荧光定量PCR检测方法。经最终实验证实,本发明的荧光定量PCR方法由于引物设计和反应体系的选取,敏感性较高,且成本低廉,能够快速实现对FCV的特异性和敏感性检测。