Problem to be solved: to provide an imaging system, an imaging method and a program capable of acquiring both images having a focus when both visible light and special light are switched while being irradiated.The imaging system 1 is capable of changing a focal length, and an optical system 51 for forming a subject image of an object illuminated by visible light or special light, and a plurality of pixels arranged in a two-dimensional matrix receive an object image formed by an optical system An image pickup device 52 for generating an image signal, an image pickup control section 58 for controlling a readout region for reading an image signal from a plurality of pixels, and a visible light irradiated by the light source device 3 based on a readout area and a special purposeAn illumination control section 994 for controlling the illumination time of the flash light is provided, and an optical control section 993 for controlling the focal length of the optical system 51 based on the readout area.Diagram【課題】可視光と特殊光とを切り替えながら両方を照射する場合において、ピントがあった両画像を取得することができる撮像システム、撮像方法およびプログラムを提供する。【解決手段】撮像システム1は、焦点距離を変更可能であり、光源装置3が可視光または特殊光を照射した被写体の被写体像を結像する光学系51と、二次元マトリクス状に配置されてなる複数の画素の各々が光学系51によって結像された被写体像を受光して画像信号を生成する撮像素子52と、記複数の画素から画像信号を読み出す読み出し領域を制御する撮像制御部58と、読み出し領域に基づいて、光源装置3が照射する可視光および特殊光の照射時間を制御する照明制御部994と、読み出し領域に基づいて、光学系51の焦点距離を制御する光学制御部993と、を備える。【選択図】図2
