本发明公开了一种水稻双花小穗基因DF1，具有Seq ID No：1所示的基因组核苷酸序列及Seq ID No：2所示的cDNA核苷酸序列；本发明还公开了上述基因编码的蛋白质，具有Seq ID NO：3所示的氨基酸序列；本发明还公开了上述基因的突变基因及其编码的蛋白质，以及含有上述基因的重组表达载体、宿主细胞，及利用上述基因调控禾本科植物小穗小花数目的方法；本发明还公开了上述基因、蛋白质等在调控禾本科植物小穗小花数目及产量上的应用。本发明利用图位克隆技术分离了一个影响水稻小穗确定性发育的DF1基因并利用转基因互补实验鉴定了该基因的功能，可通过分子设计小穗内的小花数目来提高水稻穗粒数，为培育高产新品种提供新思路和方法。
