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基于计算机模拟的CSFVE2蛋白靶向结合的肽配基序列设计及应用
专利权人:
河南省农业科学院
发明人:
张改平,王方雨,金前跃,余秋颖,郭军庆,王丽,杨苏珍,郝慧芳,王晶,胡梦华
申请号:
CN201611004956.4
公开号:
CN106749519A
申请日:
2016.11.15
申请国别(地区):
中国
年份:
2017
代理人:
张爱军
摘要:
本发明涉及基于计算机模拟的CSFV E2蛋白靶向结合的肽配基序列设计及应用,属于多肽设计及病毒抗原检测领域。其中,所述的肽配基序列为FYWRWMMK。本发明借助于分子对接及虚拟筛选技术,在黄病毒科病毒E2蛋白晶体结构的基础上,通过分子对接技术,搜寻虚拟多肽库中与靶标蛋白结合模式与亲和力最佳的肽配基,最终得到特异性结合猪瘟病毒E2蛋白的肽配基序列,其肽配基序列为FYWRWMMK,即Pep3。Pep3序列与人工表达的CSFVE2蛋白之间相互作用的平衡解离常数KD为7.54×10‑6M,即7.54μM,说明亲和力较好。本发明设计而成的Pep3序列与人工接种CSFV、人工表达CSFV E2蛋白均可以结合,除与BVDVE2蛋白反应性较高外,与其它病毒蛋白均不发生交叉性反应,特异性较好。
来源网站:
中国工程科技知识中心
来源网址:
http://www.ckcest.cn/home/

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