The present invention relates to a method or preparing a Lithospermum erythrorhizon Siebold & Zucc. extract containing shikonin and derivatives thereof using a supercritical fluid extractor and a product obtained thereby. An extract with effects of Lithospermum erythrorhizon Siebold & Zucc.-derived shiknonin and the derivatives and a method for preparing the same are provided through comparing the content of shikonin and the derivatives contained in heterogeneous extracts obtained according to a supercritical fluid extraction method and an existing organic solvent extraction method and comparing antioxidation, anti-inflammation, anti-cancer activities of shikonin and the derivatives.COPYRIGHT KIPO 2014본 발명은 초임계유체 추출장치를 이용한 시코닌 및 그 유도체를 함유하는 자초 추출물의 제조방법 및 그 생산물에 관한 것으로서 초임계 유체추출방법과 통상의 유기용매 추출 방법에 따라 얻은 상기 이종의 추출물에 함유된 시코닌 및 그 유도체 함량의 비교분석과 항산화, 항염증, 항암 활성에 대한 비교평가를 통하여 자초 유래 시코닌 및 그 유도체의 효율성 있는 추출물 및 그 방법을 제공하는 효과가 있다.