The method of cataract surgery of a patients eye includes the steps of identifying a feature selected from the group consisting of the axis of the eye, the meridian and the structure by corneal topography determining, on the outside of the optic region of the eye, , Forming a fiducial mark incision using a laser beam along a meridian or structure. The laser cataract surgical system comprises a laser source, a topography measurement system, an integrated optical subsystem, and a processor in operative communication with said laser source, said topography measurement system and said integral optical subsystem ing. The processor is configured to determine one of the patients eye axis, meridian, and structure based on measurements received from the topography measurement system and direct the treatment beam to form a radial fiducial mark incision Volatile computer readable medium with instructions.患者の眼の白内障手術の方法は、角膜トポグラフィーによって眼の軸、経線及び構造からなる群から選択される1つの特徴を特定する工程と、前記眼の光学領域の外側において、前記角膜の軸、経線または構造に沿って、レーザビームを用いて基準マーク切開を形成する工程と、を備えている。レーザ白内障手術システムは、レーザ源と、トポグラフィー測定システムと、一体的光学サブシステムと、前記レーザ源、前記トポグラフィー測定システム及び前記一体的光学サブシステムと動作可能に通信するプロセッサと、を備えている。前記プロセッサは、前記トポグラフィー測定システムから受容された測定値に基づいて患者の眼の軸、経線及び構造の1つを決定し、治療ビームを方向付けて放射状の基準マーク切開を形成するための指令を有する有形の不揮発性のコンピュータ可読媒体を有する。