Provided are: an endoscope system that reduces false colors in a halation area when a display image is generated in which a calculated image is reflected in tones, the calculated image being obtained by using two images obtained by changing an illumination light and imaging, at different timings, a target being observed; a processor device; and a method of operating the endoscope system. The endoscope system 10 is provided with: an image acquiring unit 54 which acquires a first image obtained by using a first illumination light and a second image obtained by using a second illumination light at a different timing from that of the first image; a halation area detecting unit 74 which detects a halation area; a calculated image generating unit 73 which performs calculations using the first image and the second image and generates the calculated image; a display image generating unit 77 which generates a display image in which the calculated image is reflected by tones; and a tone changing unit 75 which changes the tone of the halation area in the display image.L'invention concerne : un système d'endoscope qui réduit les fausses couleurs dans une zone de halo lorsqu'il est généré une image d'affichage dans laquelle une image calculée est réfléchie dans des tonalités, l'image calculée étant obtenue au moyen de deux images obtenues en changeant une lumière d'éclairage et en réalisant l'imagerie, à différents moments, d'une cible observée ; un dispositif de processeur ; et un procédé de fonctionnement du système d'endoscope. Le système d'endoscope (10) comporte : une unité d'acquisition d'image (54) qui acquiert une première image obtenue au moyen d'une première lumière d'éclairage et une deuxième image obtenue au moyen d'une seconde lumière d'éclairage à un moment différent de celui de la première image ; une unité de détection de zone de halo (74) qui détecte une zone de halo ; une unité de génération d'image calculée (73) qui effectue des calculs au moyen de la première