本发明提供一种提高金边胡颓子(E. pungens var. variegata)杂交授粉效率的方法,属于木本植物人工杂交育种技术领域。它包括:(1)病虫害防治;(2)采集花粉;(3)疏花;(4)去雄、套袋、人工授粉;(5)杂交种收集与层积;(6)播种。其中去雄是在金边胡颓子盛花期,将金边胡颓子每个花枝发育一致的花蕾保留,其余修剪去除。本发明的方法不但操作简单,且有效的保存花朵完整的自然结构,杂交授粉成功率高将自然杂交8%的坐果率有效的提高到65%的坐果率。本发明有效的提高金边胡颓子去雄的效率,避免了伪杂种的产生,有效的提高了杂交种的纯度和坐果率。