A method and system for processing a 3D tissue sample is provided, comprising the steps of receiving a tube with an inner space and two open ends, wherein the tube is configured to retain the 3D tissue sample in the inner space, arranging the tube so that one of the two open ends of the tube is located at a fluid channel, and forcing or actively pressing a tissue processing agent through the fluid channel and into the tube so that the tissue processing agent passes through the tissue.L'invention concerne un procédé et un système pour traiter un échantillon de tissu 3D, comprenant les étapes consistant à recevoir un tube présentant un espace interne et deux extrémités ouvertes, le tube étant conçu pour retenir l'échantillon de tissu 3D dans l'espace interne, placer le tube de telle sorte que l'une des deux extrémités ouvertes du tube est située au niveau d'un canal de fluide, et forcer ou presser activement un agent de traitement de tissu à travers le canal de fluide et dans le tube de telle sorte que l'agent de traitement de tissu passe à travers le tissu.
