A multi-energy X-ray image processing method and system thereof are disclosed. A multi-energy X-ray image processing method according to one aspect of the present invention includes acquiring a plurality of target images formed via a target to which a contrast agent is administered from a multi-energy X-ray source at a predetermined time interval step； And performing image signal processing on the target image.멀티-에너지 X-ray 영상 처리 방법 및 그 시스템이 개시된다. 본 발명의 일측에 따른 멀티-에너지 X-ray 영상 처리 방법은, 선정된 시간 구간에서 멀티-에너지 X-ray 소스로부터 조영제(contrast agent)가 투여된 타겟을 경유하여 형성된 복수의 타겟 영상을 획득하는 단계； 및 상기 타겟 영상에 대해 영상 신호 처리를 수행하는 단계를 포함한다.
