Disclosed is an automatically navigated pest control apparatus. In an unmanned flight vehicle having a container for storing medicines, the automatically navigated pest control apparatus of the present invention comprises: a communication unit for receiving, from a user terminal, position information about a plurality of points for determining a boundary of an area to which a medicine is to be applied a position information receiving unit for receiving position information of the unmanned flight vehicle a sensor unit including an altitude sensor module, for detecting the altitude of the unmanned flight vehicle a spray unit for spraying the medicines stored in the container and a controlling unit for controlling the sprayer to spray the medicines at a predetermined altitude, when the unmanned flight vehicle is located in the area, with reference to the location information of the area.COPYRIGHT KIPO 2017자동운항 방제장치가 개시된다. 약제를 저장하는 컨테이너를 구비하는 무인 비행체에서, 본 발명의 자동운항 방제장치는, 사용자 단말로부터, 약제를 살포할 영역의 경계를 결정짓는 복수의 포인트에 대한 위치정보를 수신하는 통신부 상기 무인 비행체의 위치정보를 수신하는 위치정보 수신부 상기 무인 비행체의 고도를 검출하는 고도센서모듈을 포함하는 센서부 상기 컨테이너에 저장된 약제를 살포하는 살포부 및 상기 영역의 위치정보를 참조로, 상기 영역 내에 상기 무인 비행체가 위치하는 경우, 일정 고도에서 상기 살포부가 약제를 살포하도록 제어하는 제어부를 포함한다.