The present invention, most of the organelles will make it possible to efficiently manufacture a high plant cell such as a homo- plasma electrochromic properties that have been transformed with a unique genomic DNA, the subcellular organelles traits A transformation method, the step of expressing a fusion protein comprising a targeting signal peptide functional inhibitor of the intracellular organelles to the cell organelles in the plant cell, the recovery factor of the subcellular organelles the expression cassette comprising a DNA to be expressed encodes a factor which is desired in the subcellular organelles and a step of introducing into said cell organelles of the genomic DNA of the plant cell, into the plant cell The subcellular organelle in which the expression cassette is not introduced Te is provided a method comprising the step of being disrupted by the functional inhibitor.本発明は、独自のゲノムDNAを有する細胞内小器官の殆どが形質転換されているホモプラズミック性の高い植物細胞等を効率的に作製することを可能にする、前記細胞内小器官の形質転換方法であって、前記細胞内小器官の機能阻害因子と前記細胞内小器官への移行シグナルペプチドとを含む融合タンパク質を植物細胞内にて発現させる工程と、前記細胞内小器官の回復因子と前記細胞内小器官において発現されることが所望されている因子とをコードするDNAを含む発現カセットを該植物細胞の前記細胞内小器官のゲノムDNAに導入する工程と、前記植物細胞内にて前記発現カセットが導入されなかった前記細胞内小器官が、前記機能阻害因子により破壊される工程とを含む方法を提供する。