Methods and compositions for the identification of molecular diagnostic tests for esophageal adenocarcinoma (OAC) are provided. This test defines a novel DNA damage repair deficient molecular subtype and allows classification of patients within this subtype. The present invention can be used to determine whether patients with OAC are clinically responsive or non-responsive to a treatment regimen prior to administration of any chemotherapy. This test can be used with a variety of drugs that directly or indirectly affect DNA damage or repair, such as many standard cytotoxic chemotherapeutic agents currently in use. In particular, the present invention is directed to the use of certain combinations of predictive markers whose expression correlates with responsiveness or non-responsiveness to a treatment regimen.食道腺癌(OAC)についての分子診断試験の同定のための方法および組成物が提供される。この試験は、新規DNA損傷修復欠損分子サブタイプを定義し、このサブタイプ内の患者の分類を可能にする。本発明を用いて、任意の化学療法の投与前に、OACを有する患者が治療レジメンに対して臨床的に応答性であるか、または非応答性であるかを決定することができる。この試験は、現在用いられている多くの標準的な細胞傷害性化学療法剤などの、DNA損傷または修復に直接または間接に影響する様々な薬物と共に用いることができる。特に、本発明は、治療レジメンに対する応答性または非応答性とその発現が相関する予測マーカーの、ある特定の組合せの使用を対象とする。