本发明公开一种猪细小病毒毒株及其应用,属于疫苗领域。该病毒是从广东地区采集并分离得到的,经鉴定,命名为猪细小病毒PPVGD株,于2016年03月18日保藏于中国.武汉.武汉大学的中国典型培养物保藏中心,保藏编号:CCTCC NO:V201618。其全基因序列如SEQ ID NO:1所示。将PPVGD株制备的灭活疫苗接种豚鼠后,28d后,测HI抗体效价的几何平均为1:194;接种四月龄的猪细小病毒抗体阴性的猪,在免疫28d后,测HI,抗体效价的几何平均约为1:147。可知,本发明表明了以广东分离株PPVGD株制备的灭活疫苗接种豚鼠和后备母猪后具有良好的免疫原性,且略高于商品化的灭活疫苗。