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一种锈斑蟳全基因组微卫星标记及筛选方法与应用
- 专利权人:
- 汕头大学
- 发明人:
- 马洪雨,方少彬,吴清洋,石西,林帆
- 申请号:
- CN201810593080.4
- 公开号:
- CN108753990A
- 申请日:
- 2018.06.11
- 申请国别(地区):
- 中国
- 年份:
- 2018
- 代理人:
- 张泽思`曹江
- 摘要:
- 本发明涉及一种锈斑蟳全基因组微卫星标记及筛选方法与应用,筛选方法主要包括以下步骤:锈斑蟳基因组DNA的提取;基因组文库的构建与高通量测序;测序数据的质控、组装和评估;微卫星位点的分析与筛选;微卫星位点引物的设计;使用引物对锈斑蟳不同个体的基因组DNA进行PCR扩增;使用非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测PCR扩增产物;根据扩增产物的不同迁移距离确定每个个体的基因型,从而获得锈斑蟳遗传变异的多态性图谱。采用本发明筛选得到的含有微卫星位点的序列数达到24101990个;微卫星位点总数达到3779209个。本发明不仅具有操作简单、快速、准确、灵敏、省时、省力、经济投入小等优点,还大大提高筛选效率,可应用于锈斑蟳遗传变异分析及种群遗传多样性研究。
- 来源网站:
- 中国工程科技知识中心
- 来源网址:
- http://www.ckcest.cn/home/