本发明公开了一种青蒿MYB类转录因子编码序列AaMIXTA1,其核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,该编码序列编码的氨基酸序列如SEQ ID NO:2所示。本发明的编码序列编码MYB类转录因子AaMIXTA1,正调控青蒿分泌型腺毛的密度;利用转基因技术将青蒿AaMIXTA1转录因子过量表达载体稳定转化青蒿可以有效提高青蒿表皮的分泌型腺毛密度,从而提高转基因青蒿的青蒿素的含量;利用转基因技术将青蒿AaMIXTA1转录因子干扰载体稳定转化青蒿可以有效降低青蒿表皮的分泌型腺毛密度,从而降低转基因青蒿的青蒿素的含量。该发明对于为青蒿素的规模化生产提供高产、稳定新药源具有重要意义。