本发明公开了一种烟草抗旱基因NtSAP5及其克隆方法与应用;烟草抗旱基因NtSAP5核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示;编码蛋白的氨基酸序列如SEQ ID NO:2所示;过量表达该基因能提高烟草对干旱胁迫的适应性,NtSAP5在烟草抗旱领域具有广阔的应用前景。本发明中,干旱处理的烟草幼苗叶片中,所述的泛素E3连接酶编码基因NtSAP5被诱导表达。本发明所述的蛋白NtSAP5是植物泛素化蛋白降解途径中的关键酶类,所以调控NtSAP5的表达能够调节植物对干旱的抗性。因此所述的烟草抗干旱基因NtSAP5在植物抗旱领域具有广阔的应用前景,其经济效益潜力巨大。