The present invention relates to a method for producing a high purity of chlorin e6 from chlorophyll and chlorophyll- extract . More specifically, the method for producing a high purity of chlorophyll- containing phase of the high purity of chlorophyll- a obtained in the extraction and purification of the solvent, and the specific condition from a green algae or plants containing chlorophyll , pheophytin treatment with the chlorophyll- a with an acid to phase transition , and to perform yibunja pheophytin a nucleophilic substitution reaction (SN2) to the heating condition in the presence of a base according to the method for preparing chlorin e6 comprises the step of conversion to the chloro e6.본 발명은 클로로필 추출물로부터 고순도 클로로필과 클로린 e6의 제조방법에 관한 것이다. 더욱 상세하게는 클로로필을 함유하는 녹색식물이나 미세조류로부터 특정의 용매 및 조건에서 추출 및 정제하는 고순도 클로로필의 수득단계를 포함하는 고순도 클로로필의 제조방법과, 상기 클로로필을 산으로 처리하여 페오피틴으로 전환하는 단계, 및 페오피틴을 염기 존재하에서 가온 조건으로 이분자 친핵성 치환반응(SN2)을 수행하여 클로로 e6로 전환하는 단계를 포함하여 이루어지는 클로린 e6의 제조방법에 관한 것이다.