PURPOSE: A system performing the image registration and a method thereof are provided, which transform the first image into the second image, and then performs the image registration between the transformed image and the second image, thereby the image registration is performed more accurately between images of different properties. CONSTITUTION: A processor(130) is connected to the first image providing unit(110) and the second image providing part(120). The processor is used for outputting the pixels of the second image by inputting that of the first image. The processor detects the image converting parameter for changing the first image into the second image. The processor forms the converted image by the image transformation parameter. The processor performs the image registration between the transformed image and the second image.서로 다른 영상 간에 영상 정합을 수행하는 시스템 및 방법이 개시된다. 이 시스템은, 대상체의 제1 영상을 제공하도록 동작하는 제1 영상 제공부; 대상체의 제2 영상을 제공하도록 동작하는 제2 영상 제공부; 제1 영상 제공부 및 제2 영상 제공부에 연결되어, 제1 영상의 픽셀들을 입력으로 하고 제2 영상의 픽셀들을 출력으로 하여 제1 영상을 제2 영상으로 영상 변환하기 위한 영상변환 파라미터를 검출하고, 영상변환 파라미터를 이용하여 제1 영상에 영상 변환을 수행하여 변환 영상을 형성하며, 변환 영상과 제2 영상 간에 영상 정합을 수행하도록 동작하는 프로세서를 포함한다.