The present invention relates to a processing method of an electronic banking payment system using the fingerprint and/or finger vein recognition while separating genders and generations of clients of each bank. The processing method includes the steps of: providing a fingerprint and/or finger vein payment app to a fingerprint and/or finger vein payment service server of an electronic payment system, enabling clients to access the fingerprint and/or finger vein payment service server through a communication network, and downloading and installing the fingerprint and/or finger vein payment app; obtaining the fingerprint and/or finger vein information of the clients through a fingerprint and/or finger vein recognizer thereof and providing the obtained fingerprint and/or finger vein information to the fingerprint and/or finger vein payment service server through the communication network; activating the fingerprint and/or finger vein payment app installed with the clients and registering banks in a separate manner; obtaining information having the value one for representing male users and two for representing female users to separate clients and providing the information with gender information of the client users indicated by values of one and two to the fingerprint and/or finger vein service server through the communication network; and registering the gender information while separating the users in the units of households.본 발명은 전자 결제 시스템의 지문 또는/및 지정맥 결제 서비스 서버에 지문 또는/및 지정맥 결제 앱을 제공하고, 고객 클라이언트가 통신망을 통하여 상기 지문 또는/및 지정맥 결제 서비스 서버에 접속하고, 상기 지문 또는/및 지정맥 결제 앱을 다운로드 받아서 내부에 설치하는 단계와; 상기 고객 클라이언트의 제1 지문 또는/및 지정맥 인식기를 통해 고객 자신의 제1 지문 또는/및 지정맥 정보를 획득하고, 획득된 제1 지문 또는/및 지정맥 정보를 상기 통신망을 통해 상기 지문 또는/및 지정맥 결제 서비스 서버로 제공하는 단계와; 상기 고객 클라이언트가 설치된 상기 지문 또는/및 지정맥 결제 앱을 활성화시키고, 은행을 구분하여 등록하는 단계와; 상기 고객 클라이언트을 구분하여 남자는 "1", 여자는 "2"로 입력되는 정보를 획득하고, 획득된 남자정보 "1'과 여자정보 "2"를 상기 통신망을 통해 상기 지문 또는/및 지정맥 결제 서비스 서버로 제공하는 단계와; 상기 남녀를 세대단위로 구분하여 등록하는 단계로 이루어져 있다.