The present invention provides methods for preparing decancapped cysteine protein preparations, including decancapped genetically engineered cysteine antibody preparations. The method comprises, in particular, contacting a reducing agent with a genetically engineered cysteine antibody molecule, wherein each antibody molecule has at least one capped genetically engineered cysteine residue and at least one interchain disulfide bond; And reacting the reducing agent with antibody molecules under conditions sufficient to decapped the genetically engineered cysteine residues and form cap byproducts. The method also includes removing the cap byproduct during the reduction reaction. Substantially all interchain disulfide bonds present in the antibody molecule prior to reduction are retained after reduction. Methods of making antibody conjugates using antibody conjugates, and decascopulated antibody formulations are also described.본 발명은, 탈캡핑된 유전자조작 시스테인 항체 제제를 포함하여, 탈캡핑된 시스테인 단백질 제제를 제조하는 방법을 제공한다. 상기 방법은, 특히, 환원제를 유전자조작 시스테인 항체 분자와 접촉시키는 단계(여기서, 각각의 항체 분자는 적어도 하나의 캡핑된 유전자조작 시스테인 잔기 및 적어도 하나의 쇄간 디설파이드 결합을 갖는다); 및 환원제를, 유전자조작 시스테인 잔기를 탈캡핑(decapped)하고 캡 부산물을 형성하기에 충분한 조건하에 항체 분자와 반응시키는 단계를 포함한다. 상기 방법은 또한 캡 부산물을 환원 반응 동안 제거하는 단계를 포함한다. 환원 전에 항체 분자에 존재하는 실질적으로 모든 쇄간 디설파이드 결합은 환원 후에 보유된다. 항체 접합체, 및 탈캡핑된 항체 제제를 사용하여 항체 접합체를 제조하는 방법이 또한 기재되어 있다.