The present invention is related to the use of the pituitary adenylate cyclase activating polypeptide (PACAP) for the treatment of viral infections and infectious diseases caused by viruses, in aquatic organisms. PACAP alone, or in combination with an antiviral molecule, administered orally, by injection, or by dipping baths, demonstrates its effectiveness in increasing the survival of virus-infected fish or shellfish. Furthermore, after its application it is observed that the body weight of these organisms remains the same or increases compared to that of the organisms infected and not treated with said preparations. By reverse transcription-polymerase chain reaction of tissues and organs susceptible to viral infection, it is demonstrated that PACAP or combinations containing PACAP, decrease the viral load in infected organisms.La presente invención está relacionada con el uso del polipéptido activador de la adenilato ciclasa de pituitaria (PACAP) para el tratamiento de infecciones virales y enfermedades infecciosas causadas por virus, en organismos acuáticos. El PACAP solo, o combinado con una molécula antiviral, administrado por vía oral, inyección o por baños de inmersión, demuestra su efectividad al aumentar la sobrevida de peces o crustáceos infectados por virus. Además, tras su aplicación se observa que el peso corporal de estos organismos se mantiene igual o aumenta en comparación con el de los organismos infectados y no tratados con dichas preparaciones. Mediante reverso transcripción-reacción en cadena de la polimerasa de tejidos y órganos susceptibles a la infección viral se demuestra que el PACAP o las combinaciones que contengan PACAP, disminuyen la carga viral en los organismos infectados.