An object of the present invention is to provide a method capable of effectively suppressing microorganisms in water system. In the method for inhibiting microorganisms in water, a combination of a chlorine-based oxidizing agent and sulfamic acid or a salt thereof, or a chemical agent comprising chlorosulfonic acid or a salt thereof, and an inorganic or organic slime control agent are used in combination. It is preferable that this method is provided with a step of simultaneously adding or adding a slime control agent. For example, a step of adding a medicament and a slime control agent to a place where a slime disorder is detected may be provided.본 발명의 과제는, 수계의 미생물을 효율적으로 억제할 수 있는 방법을 제공하는 것이다.수계의 미생물 억제방법은, 염소계 산화제 및 술팜산 혹은 그 염의 조합, 또는 클로로술팜산 혹은 그 염으로 이루어지는 약제와, 무기계 또는 유기계의 슬라임 컨트롤제를 병용한다. 이 방법은, 약제의 첨가를 슬라임 컨트롤제의 첨가와 동시에 또는 그 전에 하는 공정을 구비하는 것이 바람직하다. 예를 들면 슬라임 장해가 검출된 장소에 약제 및 슬라임 컨트롤제를 첨가하는 공정을 구비하면 좋다.