本发明公开了一种细胞壁合成相关蛋白UGMA及其编码基因与应用,属于生物技术领域。细胞壁合成相关蛋白UGMA或编码该蛋白的基因的应用,包括如下任一项:在降低植物真菌病原致病力方面的应用;在抑制植物真菌病原生长发育方面的应用;在筛选和/或制备UGMA蛋白抑制剂方面的应用;在筛选和/或制备植物真菌病害药物方面的应用;所述UGMA的氨基酸序列如SEQ ID NO:1所示;所述基因的核苷酸序列如SEQ ID NO:2所示。本发明通过敲除病原菌中的ugmA基因,获得ugmA基因缺失突变体,发现其生长及致病能力受到严重抑制,细胞壁异常增厚。本发明还通过虚拟筛选获得靶向化合物,为绿色农药的研发提供了新的途径。