本发明属于水稻盐敏感突变的技术领域,具体涉及一种水稻盐敏感突变基因SS2、突变体ss2以及应用。所述突变基因SS2的核酸序列如序列表SEQ ID NO.1所示,氨基酸序列如序列表SEQ ID NO.2所示。所述水稻盐敏感突变基因SS2为水稻LOC_Os10g41780的第2外显子(基因编码区第259位碱基)发生单碱基替换(C突变为T),使编码蛋白序列第87位的谷氨酰胺(Gln)突变成终止密码的突变基因,其通过抑制盐胁迫下糖分从源叶到库根的分配,导致ss2盐敏感,以及通过减少蔗糖等碳水化合物的供应来抑制植株的生长,降低ss2盐胁迫适应性,能够应用于水稻的生长和盐胁迫响应方面的研究。