The present invention is a method of enriching at least one bacterial species from a target bacterial system, including: culturing the target bacterial ecosystem in a culture media in a single-stage chemostat under the following conditions: (i) a system retention time of about 5 to about 290 hours, (ii) a temperature of about 37°C, (iii) a pH of about 6.8 to 7, and (iv) maintenance of anaerobic conditions to the chemostat for a time sufficient to enrich the at least one bacterial species; where the culture media comprises a prepared starch substrate, and where the target bacterial system is a fecal derived sample obtained from a patient that has not been treated with an antibiotic for at least 6 months.La présente invention concerne un procédé d'enrichissement d'au moins une espèce bactérienne dans un système bactérien cible, comprenant : la mise en culture de l'écosystème bactérien cible au sein d'un milieu de culture dans un chemostat à étage unique dans les conditions suivantes : (i) un temps de séjour du système d'environ 5 à environ 290 heures, (ii) une température d'environ 37 °C, (iii) un pH d'environ 6,8 à 7, et (iv) le maintien de conditions d'anaérobies du chemostat pendant une durée suffisante pour enrichir la ou les espèces bactériennes ; où le milieu de culture comprend un substrat d'amidon préparé, et où le système bactérien cible est un échantillon dérivé de matière fécale obtenue à partir d'un patient qui n'a pas été traité au moyen d'antibiotique pendant au moins 6 mois.