本发明公开了一种稻瘟病菌无毒基因AvrPik/kp/km/kh/7及其应用。所述稻瘟病菌(Magnaporthe oryzae)新无毒基因AvrPik/kp/km/kh/7具有SEQ ID No.1所示的带有启动子的DNA序列,具有SEQ ID No.2所示的cDNA序列。所述基因在自然界中存在3个SNP单元型。本发明还涉及了根据该基因的结构及其功能设计新型农药的分子靶点;将该基因和相应的抗病基因共价导入水稻等寄主植物培育抗病品种;根据该基因序列产生的特异性分子标记在田间稻瘟病菌群体监测中的应用;以及根据监测的结果指导抗病品种合理布局中的应用。