The present invention provides an incubation system for fish larva which automatically mixes a liquid feed in an aquaculture tank at a proper flow rate to increase the survival rate of early-stage larval eels and to manage the early-stage larval eels in large amounts. The circulation rate and location of water is adjusted to exact figures which do not impose stress on the early-stage larval eels for an increased survival rate and mass production of the early-stage larval eels.본 발명은 사육수조내의 액상사료를 적절한 유속으로 자동으로 섞어 뱀장어 초기 부화자어들의 생존율을 향상시키고 대량으로 관리 할 수 있는 자어 사육 시스템 자동화 장치를 제공함으로서 간편하면서도 안정적이고 대량생산이 가능한 뱀장어 초기 자어를 사육하기 위해 뱀장어 초기 부화자어가 스트레스를 받지 않는 물의 순환속도 및 위치의 정확한 수치를 조정함으로서 뱀장어 자어의 생존율을 증가와 뱀장어 자어를 대량으로 생산할 수 있다.