本发明涉及与小麦叶片叶绿素含量和粒重相关的基因TaBAS1-2B及其Indel标记。本发明首次从小麦中分离克隆到与小麦叶片叶绿素含量和粒重相关的基因TaBAS1-2B,并根据所克隆的TaBAS1-2B基因序列,在‘京411’和‘红芒春21’两个品种间开发出具有多态性的Indel标记,并在194份小麦自然品种中分析其对表型的作用,最终开发出与基因TaBAS1-2B共分离的,且与小麦叶片叶绿素含量和粒重紧密相关的功能标记。该Indel标记能够分别解释小麦花后旗叶叶绿素含量及千粒重表型变异的8.2%和4.4%,其中,分子量大小为494bp(Seq ID No.3)的条带对粒重的增加具有增效作用,分子量大小为493bp(Seq ID No.4)的条带对粒重的降低具有增效作用。该分子标记的开发为高产小麦分子辅助育种提供了一条可行的途径。