The processing device 3 of the endoscope system 1 according to the present invention corresponds to each content of image processing respectively performed according to the image processing unit 31 constituted by an FPGA and the imaging device 25 of the endoscope 2 to be mounted A configuration memory 32 for storing a plurality of pieces of configuration data stored in the configuration memory 32 and configuration data corresponding to the imaging element 25 of the attached endoscope 2 among the plurality of configuration data stored in the configuration memory 32 And a configuration control unit 33 a that performs control to reconfigure the FPGA of the image processing unit 31.本発明にかかる内視鏡システム1の処理装置3は、FPGAで構成される画像処理部31と、装着される内視鏡2の撮像素子25に応じてそれぞれ行われる画像処理の各内容に対応した複数のコンフィグレーションデータを記憶するコンフィグレーションメモリ32と、コンフィグレーションメモリ32に記憶された複数のコンフィグレーションデータのうち、装着された内視鏡2の撮像素子25に応じたコンフィグレーションデータを用いて画像処理部31のFPGAをリコンフィグレーションさせる制御を行うコンフィグレーション制御部33aとを備える。