本发明首次提供转基因抗虫水稻科丰6号品系特异性的RPA检测方法。具体公开了一种适用于重组酶聚合酶等温扩增技术(Recombinase Ploymerase Amplification, RPA)鉴定含有转基因抗虫水稻科丰6号的引物及探针组合,其正向引物序列如SEQ ID No.1所示,反向引物序列如SEQ ID No.2所示,探针序列如SEQ ID No.3所示。本发明还公开了一种鉴定含有转基因抗虫水稻科丰6号的方法:提取待测样品的DNA作为模板,利用所述的引物进行RPA快速扩增及实时荧光检测,如果得到明显的扩增曲线,则证明所检样品中含有转基因抗虫水稻科丰6号的成分。