Disclosed are a method and a system for eliminating a bio-film using a large output millimetric wave. A system for eliminating a bio-film using a large output millimetric wave according to a favorable embodiment of the present invention emits a large output millimetric wave beam toward a target object for the beam to penetrate the surface of the target object for a few hundred micrometers to remove a bio-film. The system for eliminating a bio-film using a large output millimetric wave comprises the following: a millimetric wave emission device a guiding device reflecting the millimetric wave output from the millimetric wave emission device and outputting the millimetric wave toward a target object with a bio-film a transfer device moving and rotating the target object and a control device controlling a guiding direction of the guiding device and controlling the transfer device.COPYRIGHT KIPO 2017본 발명은 고출력 밀리미터파를 이용한 바이오 필름 제거 방법 및 시스템을 공개한다. 본 발명의 바람직한 실시예에 따른 바이오 필름 제거 시스템은, 고출력 밀리미터파 빔을 대상 물체에 조사하여, 대상 물체의 표면으로부터 수백 마이크로미터 이내로 침투시켜 바이오필름을 제거한다. 본 발명의 고출력 밀리미터파를 이용한 바이오 필름 제거 시스템은, 밀리미터파 조사 장치 상기 밀리미터파 조사 장치로부터 출력된 밀리미터파를 반사시켜 바이오필름이 형성된 대상물체로 출력하는 가이딩 장치 상기 대상 물체를 이동 및 회전시키는 이송 장치 및 상기 가이딩 장치의 가이드 방향을 제어하고, 상기 이송 장치를 제어하는 제어장치를 포함한다.