本发明提供了通过DNA改组技术获得的新的植物强耐盐基因AtNHXS1,此基因编码的Na+/H+逆向转运蛋白比野生型Na+/H+逆向转运蛋白ATNHX1具有更强的离子转运活性的。此基因的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示,也包括与序列表中序列1核苷酸序列同源性在70~100%之间的基因,或编码序列表中序列2氨基酸序列的核苷酸序列。这种新的Na+/H+逆向转运蛋白,是具有序列表中序列2氨基酸序列的蛋白质或与序列2氨基酸序列同源性在70~100%之间的蛋白质或将序列2氨基酸序列中取代、缺失或添加一个或几个氨基酸且具有相同活性的蛋白质。本发明还提供了重组载体的构建、转基因植物等方法以应用上述基因和蛋白质,可培育耐盐性更强或其他生物学性状得到改善的转基因植物新品种。