To provide a radiography system, a radiography method, a radiography program, and a body thickness estimation apparatus that can estimate a body thickness of a subject using each of radiographic images generated by applying radiations with different energy levels.SOLUTION: A radiography system 10 includes: a radiography apparatus 16 including two radiation detectors; and a console 18 including an estimation unit that estimates a body thickness of a subject W, using a ratio of pixel values between regions corresponding to a soft part tissue of the subject W in corresponding regions of radiographic images generated respectively by the two radiation detectors when radiations with different energy levels are applied and correlation information in which the ratio and a body thickness are associated with each other.SELECTED DRAWING: Figure 1【課題】エネルギーの異なる放射線が照射されることにより生成された放射線画像の各々を用いて、被検体の体厚を推定することができる放射線画像撮影システム、放射線画像撮影方法、放射線画像撮影プログラム、及び体厚推定装置を得る。【解決手段】放射線画像撮影システム10は、2つの放射線検出器を含む放射線画像撮影装置16と、エネルギーの異なる放射線が照射されることにより2つの放射線検出器の各々によって生成された放射線画像同士の対応する領域であって、かつ被検体Wの軟部組織に対応する領域の画素値の比、及び比と体厚とが対応付けられた対応関係情報を用いて被検体Wの体厚を推定する推定部を含むコンソール18とを備える。【選択図】図1