本发明提供一种利用SSR分子标记鉴定杏品种的方法，本发明首先利用生物学特征差别较大的5个杏品种进行了大量引物的筛选，从190对SSR引物中筛选出38对多态性好、主带清晰的引物进行样品的聚丙烯酰胺凝胶分析，最后又从6％聚丙烯酰氨凝胶电泳胶图中选出特异带清晰、非特异带少、多态性高的10个SSR标记的图谱进行读带分析。通过对读带数据的分析，最终筛选出鉴别效率最高的一个引物组合，由3对引物组成(PSSR1、PSSR2和PSSR3，引物序列如Seq ID No.1‑6所示)，可将124个杏品种一一区别开来。本发明的利用SSR分子标记鉴定杏品种的方法具有快速、准确、低成本、操作简单、节约人力、物力及土地资源等优点，具有十分广阔的应用前景。
